തൃശൂര് ജില്ലയിലെ പായമ്മല് ശത്രുഘ്നസ്വാമി ക്ഷേത്രം പലപ്പോഴും വിശ്വാസികള്ക്കിടയില് സവിശേഷമായാണ് നിലകൊള്ളുന്നത്.
സ്വപ്നദര്ശനത്തിലെ നിര്ദേശാനുസരണം വക്കയി കൈമള് അവസാനമായി നിര്മ്മിച്ച ക്ഷേത്രമാണിത്. അദ്ദേഹം പ്രതിഷ്ഠിച്ച മറ്റു മൂന്നു വിഗ്രഹങ്ങളെ പോലെ തന്നെ, ശ്രീരാമ സഹോദരനായ ശത്രുഘ്നസ്വാമിയുടെ വിഗ്രഹവും സാക്ഷാല് ശ്രീ കൃഷ്ണന് ദ്വാരകയില് പൂജിച്ചിരുന്നതാണെന്നാണ് വിശ്വാസം. ഐതിഹ്യ പ്രകാരം ദ്വാരക നഗരം കടലെടുത്തുകഴിഞ്ഞു സഹസ്രാബ്ദങ്ങള്ക്കു ശേഷം ഈ വിഗ്രഹങ്ങള് കേരളതീരത്തെത്തി ചേരുകയായിരുന്നത്രേ.
മഹാവിഷ്ണുവിന്റെ കൈയ്യിലെ സുദര്ശന ചക്രമാണ് ശത്രുഘ്നനായി അവതാരമെടുത്തതെന്നാണ് വിശ്വാസം. നാലമ്പലങ്ങളില് (തൃപ്രയാര് ശ്രീരാമസ്വാമി ക്ഷേത്രം, ഇരിഞ്ഞലക്കുട കൂടല്മാണിക്യ ക്ഷേത്രം, മൂഴിക്കുളം ലക്ഷ്മണപെരുമാള് ക്ഷേത്രം, പായമ്മാള് ശത്രുഘ്നസ്വാമി ക്ഷേത്രം) ഏറ്റവും ചെറുതും ഈ ക്ഷേത്രം തന്നെ. അതുപോലെ തന്നെ.യാണ്. മറ്റു മൂന്ന് ക്ഷേത്രങ്ങള്ക്കും വൃത്താകൃതിയിലുള്ള ശ്രീകോവിലുള്ളപ്പോള്, ഇവിടുത്തെ ശ്രീകോവില് ദീര്ഘചതുരത്തിലാണ്. ശാന്തതയും സ്വച്ഛതയും കളിയാടുന്ന ഈ ക്ഷേത്രത്തില് വന്നു തൊഴുന്ന ഭക്തര്ക്ക് സ്വസ്ഥത കൈവരാറുണ്ട്. നാലമ്പല ദര്ശനം നടത്തുമ്പോള് ഏറ്റവും അവസാനം സന്ദര്ശനം നടത്തേണ്ടത് പായമ്മല് ശത്രുഘ്നസ്വാമി ക്ഷേത്രത്തിലാണ്.
ടിപ്പുവിന്റെ കാലത്തു ആക്രമണം പേടിച്ചു ക്ഷേത്രത്തിലെ പഞ്ചലോഹ വിഗ്രഹം ക്ഷേത്രക്കുളത്തില് നിമഞ്ജനം ചെയ്തിരുന്നു. ഈ വിഗ്രഹം പിന്നീട് കണ്ടെടുക്കാനായില്ല. അതിനാല് പുതിയൊരു കല്വിഗ്രഹം കൊണ്ട് പുനഃപ്രതിഷ്ഠ നടത്തുകയാണുണ്ടായത്. ഇരിഞ്ഞാലക്കുട കൊടുങ്ങല്ലൂര് റോഡിനഭിമുഖമായി വെല്ലന്കല്ലൂരില് നിന്ന് ആറ് കിലോമീറ്റര് അകലെയാണ് ഈ ക്ഷേത്രം സ്ഥിതി ചെയുന്നത്. ഇരിഞ്ഞാലക്കുട കൂടല്മാണിക്യ ക്ഷേത്രത്തില് നിന്നും 7 കിലോമീറ്റര് അകലെ. ഗണപതിയാണ് ഉപപ്രതിഷ്ഠ. സുദര്ശനചക്രം അര്പ്പിക്കുന്നതും, സുദര്ശന പുഷ്പാഞ്ജലിയും ഇവിടുത്തെ പ്രധാന വഴിപാടാണ്. സ്വസ്ഥത കൈവരാന് ഇത് ഉപകരിക്കുമെന്നാണ് വിശ്വാസം.